Σποραδικές πληροφορίες αναφέρουν την ύπαρξη ομάδας υδατοσφαίρισης του Πανιωνίου στη Σμύρνη μετά το 1910. Μάλιστα, αθλητής υπήρξε και ο Αριστοτέλης Ωνάσης. Από το 1906 διεξάγονταν στην προκυμαία της Μελαντίας τα «Πελόπεια», ετήσιοι ναυτικοί και κολυμβητικοί αγώνες από τον τοπικό σύλλογο Πέλοπα.Είναι γνωστό ότι στα τελευταία Πελόπεια του 1922 έγιναν και αγώνες υδατοσφαίρισης μεταξύ των σωματείων Πανιώνιος,Πέλοψ Μελαντίας και Απόλλων. Μετά την καταστροφή υπάρχουν ελάχιστες πληροφορίες για την ομάδα υδατοσφαίρισης του Πανιωνίου, όπως ότι στις 18 Ιουλίου 1926 αγωνίστηκε με τον Εθνικό Πειραιά στο Τουρκολίμανο:

«Εις τον όρμον Κουμουνδούρου (Τουρκολίμανο), σήμερον Κυριακήν τελείται αγών ουώτερ- πόλο μεταξύ των ομάδων Πανιωνίου Σμύρνης και Εθνικού Ομίλου Φιλάθλων Πειραιώς-Φαλήρου.»

Νικητής αναδείχθηκε ο Εθνικός με 5-2 και την επόμενη Κυριακή δόθηκε η ρεβάνς. Μια Κυριακή αργότερα η μικτή των δύο συλλόγων αντιμετώπισε τον Όμιλο Καστέλας. Τον Αύγουστο έλαβε μέρος στους Πανελλήνιους Κολυμβητικούς Αγώνες που διοργάνωσε ο ΣΕΓΑΣ, στους οποίους είχαν ενταχθεί και οι πανελλήνιοι αγώνες υδατοσφαίρισης. Μετείχαν άλλες τέσσερις ομάδες, με τις οποίες σημείωσε μία νίκη και τρεις ήττες, τερματίζοντας στην 4η θέση. Έφερε τα εξής αποτελέσματα: με Ν.Ο. Καστέλας 0-2, με Άρη Θεσ. 4-1, με Εθνικό Πειραιά 1-5 και με Ηρακλή Θεσσαλονίκης 0-4.Αλλά η προσπάθεια αυτή μάλλον δεν ήταν σοβαρή, διότι δεν αναφέρεται άλλη σχετική δράση της ομάδας πόλο.Το τμήμα επανιδρύθηκε το 1985, έπειτα από τη δημιουργία του κολυμβητηρίου Νέας Σμύρνης. Αρχικά, στελεχώθηκε από πρώην αθλητές του κολυμβητικού τμήματος. Για πρώτη φορά έλαβε μέρος στο Πανελλήνιο Πρωτάθλημα Δ΄ Εθνικής κατηγορίας, όπου κατέλαβε την 3η θέση και ανέβηκε στην Γ΄ Εθνική κατηγορία.

Πηγές:Wikipedia,Αθλητικός κόσμος