Η πρώτη ευρωπαική εμφάνιση του ποδοσφαρικού τμήματος του Πανιωνίου έγινε στο κύπελλο Ράπαν το καλοκαίρι του 1964,όπου αγωνίστηκε στην θέση του Ολυμπιακού. Σε αυτήν την διοργάνωση αγωνίστηκε εναντίον της Μάλμε,της Τουλούζ και της Ντιναμό Ζάγκρεμπ. Τη σεζόν 1969-70 συμμετάσχε στο κύπελλο Διεθνών Εκθέσεων,όπου αποκλείστηκε από την Γερμανική Χάνσα Ροστόκ. Δύο σεζόν αργότερα,αγωνίστηκε στο κύπελλο UEFA,όπου αποκλείστηκε στην δεύτερη φάση από την Φερεντσβάρος,έχοντας αποκλείσει την Ατλέτικο Μαδρίτης στον προηγούμενο γύρο. Ακολούθησε η σεζόν 1979-80 στην ευρωπαική ιστορία των κυανοέρυθρων,στο κύπελλο κυπελλούχων όπου και αποκλείστηκε στην Β φάση από την σουηδική Γκέτεμποργκ. Οκτώ χρόνια μετά επέστρεψε στην ευρώπη, όπου αποκλείστηκε στο κύπελλο UEFA από την Τουλούζ στην Α φάση.

Πέρασαν έντεκα χρόνια μέχρι ο Πανιώνιος να κάνει την καλύτερη Ευρωπαική πορεία του,την σεζόν 1998-99 στο κύπελλο κυπελλούχων,όπου αποκλείστηκε στην φάση των οχτώ από την Λάτσιο. Η ευρωπαική πορεία του επέστρεψε λίγα χρόνια αργότερα,όπου για δύο διαδοχικές σεζόν 2003-04 και 2004-05 συμμετείχε στο κύπελλο UEFA,φτάνοντας στην Β φάση και στην φάση των ομίλων αντίστοιχα. Τρία χρόνια αργότερα αγωνίστηκε ξανά στην Ευρώπη για δύο συνεχόμενες σεζόν το 2007-08 και 2008-09,όπου αγωνίστηκε με σπουδαίες ομάδες όπως η Γαλατασαράι και η Νάπολι.

Η τελευταία και πιο πρόσφατη ευρωπαική του πορεία ήταν στην προκριματική φάση του UEFA Europa League τη σεζόν 2017-18,όπου αποκλείστηκε από την Μακάμπι Τελ Αβίβ.

Πηγή :Wikipedia